Esta zona posee un clima semidesértico, horadado por quebradas y antiguos cursos de aguas orientados en dirección este/oeste, a 42 kilómetros al sur de la ciudad de La Serena, cerca del balneario de Guanaqueros.
Tongoy se encuentra ubicado en un promontorio de roca frente al Océano Pacífico, que alcanza los 60 m de altura, entre las playas Socos (2 km) y Grande (14 km), al norte de la Cordillera de Talinay.
El Estero de Tongoy desemboca en la Playa Socos, mientras que las quebradas de Camarones y Los Almendros mueren antes de llegar al mar, mientras que las de Los Litres y la de Pachingo, forman pequeñas lagunas costeras donde se han formados grandes Humedales.